Jurusan Akuntansi Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Musamus bertujuan untuk menghasilkan lulusan yang kompeten, berintegritas, dan berdaya saing nasional dengan menjunjung tinggi profesionalisme dan etika. Melalui pendidikan berkualitas, pengembangan riset, penerapan etika profesi, serta kerja sama nasional dan internasional, jurusan ini membekali mahasiswa dengan kompetensi di bidang akuntansi perpajakan, manajemen, sektor publik, dan auditing, serta mendorong terciptanya tata kelola yang baik di berbagai sektor publik dan swasta.

Jurusan Manajemen Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Musamus berkomitmen menghasilkan sumber daya manusia yang berdaya saing di kawasan regional timur melalui pemanfaatan ilmu manajemen berbasis teknologi dan kewirausahaan. Melalui penyelenggaraan pendidikan berbasis MBKM, pengembangan penelitian, pengabdian kepada masyarakat, serta tata kelola yang akuntabel dan transparan, jurusan ini terus meningkatkan kualitas pengelolaan pendidikan secara berkelanjutan guna mencetak lulusan yang profesional, inovatif, dan siap menghadapi tantangan dunia kerja.

Jurusan Ekonomi Pembangunan Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Musamus berkomitmen menghasilkan lulusan yang berdaya saing, adaptif, dan berlandaskan nilai-nilai lokal dalam mendukung pembangunan ekonomi yang berkelanjutan. Melalui pendidikan berbasis penelitian, pengembangan mutu pembelajaran, pengabdian kepada masyarakat, serta kerja sama dengan berbagai pemangku kepentingan, jurusan ini membekali mahasiswa dengan kompetensi di bidang ekonomi pembangunan, perencanaan wilayah, dan pengelolaan sumber daya ekonomi secara profesional dan beretika.